Comme le Mega 2560 et l'Uno, il intègre un ATmega8U2 programmé comme convertisseur USB-série.
La révision 3 de la carte présente les nouvelles fonctionnalités suivantes :
Brochage 1.0 : ajout des broches SDA et SCL à proximité de la broche AREF, ainsi que de deux nouvelles broches à proximité de la broche RESET (IOREF) permettant aux shields de s'adapter à la tension fournie par la carte. À l'avenir, les shields seront compatibles avec la carte utilisant l'AVR, fonctionnant en 5 V, et avec l'Arduino Due, fonctionnant en 3,3 V. La seconde broche, non connectée, est réservée à des applications ultérieures.
